Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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