Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFDQ9GZP0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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