Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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