Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FOXQ1Q9C009 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXQ1Q9C009 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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