Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ROPN1BQ9BZX4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms