Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms