Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AF186996.2-201ENST00000508347 907 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003063.1-203ENST00000529827 461 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CXorf56-203ENST00000536133 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC078950.1-204ENST00000540635 523 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL352979.1-201ENST00000554238 297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245033.1-201ENST00000562833 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf186-209ENST00000603488 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PSG3-206ENST00000614582 1287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB12-209ENST00000617311 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008957.2-201ENST00000618632 396 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB13-207ENST00000618637 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NPIPB5-227ENST00000621622 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10N1P-203ENST00000641736 1305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SUCLA2P3-201ENST00000458157 1357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018647.1-201ENST00000432866 1414 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104472.1-201ENST00000399242 1585 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FRG2DP-203ENST00000569028 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF4-208ENST00000543082 2399 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4C50P-201ENST00000330155 930 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCF2-201ENST00000333127 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1J2-201ENST00000335302 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NPSR1-206ENST00000381553 856 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNIP1-204ENST00000411494 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA1P39-201ENST00000440547 960 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 E2F6P4-201ENST00000468625 514 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms