Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
RETNLBQ9BQ08 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms