Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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