Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms