Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC97Q96F63 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms