Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms