Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL2Q92772 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL2Q92772 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL2Q92772 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL2Q92772 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKL2Q92772 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL2Q92772 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms