Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPBP1Q92547 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPBP1Q92547 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms