Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms