Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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