Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms