Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC117Q8IWD4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms