Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms