Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ALDH7A1-228ENST00000636886 2321 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms