Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms