Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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