Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTXN3Q4LDR2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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