Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4L6Q3SYB3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms