Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC57Q2TAC2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms