Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms