Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms