Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms