Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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