Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms