Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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