Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TCIRG1Q13488 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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