Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AF064858.1-201ENST00000417335 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms