Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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