Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK3Q13003 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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