Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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