Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms