Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms