Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms