Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms