Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms