Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COG7P83436 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG7P83436 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG7P83436 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms