Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P62684 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms