Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB8AP61006 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms