Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms