Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms