Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC11A1P49279 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms