Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCC3P46736 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms