Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms