Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMPOP42166 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMPOP42166 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms